Pour Jean-Jacques Pérennès, on ne voit le monde musulman qu’à travers une sorte de «brouillard géopolitique», fait de djihadisme et de terrorisme. Nouer une amitié avec un musulman permettrait, en revanche, de voir au-delà du prisme déformant de l’actualité. Sa carrière et son engagement viennent de lui valoir le titre de docteur honoris causa de la Faculté de théologie de l’Université de Fribourg.